Puce d’hybridation génomique comparative

L’hybridation génomique comparative sur puce ou Array comparative genomic hybridization (aCGH) est une technique de cytogénétique permettant d’analyser les variations du nombre de copies de l’ADN. Elle fait appel à une puce sur laquelle les nucléotides des régions que l’on veut analyser sont fixés. On utilise une quantité égale d’ADN normal (sans anomalie cytogénétique) et d’ADN à tester (ici de l’ADN supposé tumoral extrait à partir des cellules urothéliales retrouvées dans les urines ou directement depuis la tumeur). Chaque ADN est marqué par un colorant fluorescent de couleur différente par exemple vert pour l’ADN normal et rouge pour l’ADN tumoral. Ce mélange est appliqué sur la puce et les deux ADN entrent en compétition pour s’hybrider aux nucléotides présents sur la puce. Lorsqu’une quantité similaire d’ADN est présente, les nucléotides émettront une coloration jaune (mélange de rouge et vert). Si une partie de chromosome manque dans la tumeur, seul le colorant vert de l’ADN normal sera présent et les nucléotides concernés émettront une coloration verte, marquant une délétion de la zone concernée dans l’ADN tumoral. Inversement, en cas d’amplification, le signal rouge sera prépondérant. Un scanner optique à haute résolution permet de mesurer le signal lumineux émis sur chaque nucléotide qui est ensuite analysé à l’aide d’algorithmes bioinformatiques dédiés.